Iniziato come progetto universitario all'Università di Washington, avendo come obiettivo la realizzazione di un sostituto per il noto Paint di Windows, Paint.NET è diventato un potente strumento per la manipolazione di immagini e fotografie digitali senza perdere la sua semplicità originaria.
Tra le caratteristiche principali ricordiamo la possibilità di manipolare i layer, la possibilità di aggiungere componenti digitali all'immagine attraverso l'impiego di appositi strumenti per la realizzazione di curve di Bezier e di curve Spline, senza dimenticare la possibilità di undo illimitati, caratteristica propria dei software più professionali.